这两种分区都基于SCI收录的期刊影响因子基础之上进行：一种是科睿唯安公司制定的分区，即JCR分区；一种是中国科学院国家科学图书馆制定的分区，简称中科院分区。

科睿唯安每年出版JCR《期刊引用报告》，JCR将收录期刊分为176个不同学科类别，每个学科分类按照期刊的影响因子高低，平均分为Q1、Q2、Q3和Q4四个区:

各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为Q1区

前25%~50%(含50%)为Q2区

前50%~75%(含75%)为Q3区

75%之后的为Q4区

这就是JCR分区，期刊的数量平均分为四个。

中科院分区是将JCR中所有期刊分为数学、化学、生物、地学、天文、工程技术、医学、环境科学、农林科学、社会科学、管理科学以及综合性期刊13大类。然后按照各类期刊影响因子分别将每个类别划分为以下4个区:

前5%的期刊为1区

6%-20%的期刊为2区

21%-50%的期刊为3区

剩下的50%就是4区期刊

在中科院的分区中,期刊数量呈金字塔状分布，这样一区的期刊就很少，导致有些期刊在JCR中能排到Q1，但是在中科院分区中，只能处于2区或3区。

尽管两种分区方式都比较权威，但是国际上普遍认可JCR分区，而国内则更倾向于中科院分区。

当然，实际生活中，不同机构对两种分区认可度不同，有的单位甚至还有自己的分区。因此，作者投稿前最好先确认自己单位认可哪个分区，或者究竟是怎么分区的，避免出错。